أولت الجامعة منذ نشأتها اهتماماً كبيراً بالعلاقات والتواصل بين المؤسسات العلمية وذلك إيماناً منها بأهمية التواصل والتفاعل البناء بين الشعوب المختلفة ومن أجل خدمة القضايا الإنسانية المشتركة، ومن ثم فإن هناك تعاوناً بين الجامعة وبين عدد من الجامعات العالمية والاتحادات التعليمية والمؤسسات المهتمة بالتعليم، بهدف تقوية أواصر التعاون والتكامل في مختلف الأصعدة، وعليه فإن الجامعة تحظى بعضوية كاملة في المنظمات العلمية الآتية:

1. اتحاد الجامعات العربية.

2. اتحاد جامعات العالم الإسلامي.

3. رابطة المؤسسات العربية الخاصة للتعليم العالي.

4. رابطة الجامعات الإسلامية.

وقد وقعت الجامعة اتفاقات التعاون مع عدد من الجامعات العالمية وكذلك مع عدد من المؤسسات المهتمة بالتعليم والبحث العلمي في مجالات المؤتمرات العلمية، تبادل الأساتذة، الأنشطة الطلابية، الندوات والدورات العلمية، كما أن هناك تعاوناً وتنسيقاً بين الجامعة وبين المؤسسات المهتمة بالثقافة والتعليم مثل المنظمة الإسلامية للتربية والثقافة والعلوم (الإيسسكو) والمنظمة العربية للتربية والثقافة والعلوم(الأليسكو).